No deberia repetir post solo modificar el que ya hiciste. Dicho esto tienes un par de "problemas" uno es el IOS28 y el IOS36, para arreglarlos debes descargarlos con NUS Downloader e instalarlos con Wad Manager, o podrias actualizar la consola (aunque ya este en la ultima version) mediante la opcion de Actualizar en la configuracion de la misma y ver si los actualiza ya que estan en una version anterior. En dado caso de que no se actualizen procede a descargarlos e instalarlos para ello: abres Nus Downloader esperas a que cargue la base de datos das click en la opcion Database... luego IOS buscas IOS28 y eliges la v1807 ya elegida debes tener tildada la opcion Pack WAD (solo esa) y dar a Start NUS Download, comenzara la descarga, al finalizar te creara una carpeta llamada titles al final de dicha carpeta (000000010000001C) estara el archivo wad solo copia y pega en tu sd. Para descargar el IOS36 es el mismo proceso solo eliges el IOS36 y la v3608 y descarga el archivo al final de la carpeta (0000000100000024) igual copia y pega en tu sd. Las descargas son de una en una para la instalacion puedes tener ambas en la sd.

Para instalarlas solo abres wad manager eliges la ruta ruta donde tienes los wad y los instalas. Ya que tengas instalados ls dos IOS crea un nuevo syscheck y asegurate de que esten bien instalados (IOS28 (rev 1807): Sin Parches     IOS36 (rev 3608): Sin Parches) si ya estan bien toca instalar los cIOS.

En tu caso te falta el mas importante de los cIOS ya que es el que hace funcionar la mayoria de apps/juegos el IOS249 que debe tener el cIOS D2X, para instalarlo hay dos formas una es con el D2X cIOS Installer y la otra es con ModMii, el Installer se usa en la consola y el ModMii es lo mismo que nus descarga un wad y lo instalas. Para instalar con D2X cIOS Installer sigue la guia de como inatalar. En la opcion modmii solo descargas el programa lo abres sigues las instrucciones de acceso, vas a la pagina numero 4 y descargas la opcion 24938 y de paso la 25058, una vez comienza la descarga te creara una carpeta llamada copy to sd y dentro una carpeta wad con los archivos, copia, pega e instala con wad manager. Tambien podrias instalar los cIOS de Hermes que te faltan IOS222 y IOS223 v5.1 igual ya sea con el instalador o desde el mismo modmii.

Con esto no deberia tener ningun problema, en si los mas importantes son el IOS36 ya que varios juegos lo usan y el IOS249 (cIOS D2X) que este se usa para lo mismo.

PD. Una vez que la consola esta pirateada el formateo lo unico que hace es causar problemas si quieres una consola lo mas virgen que se pueda solo debes remplazar/desinstalar cosas nunca formatear. Tambien recuerda instalar Priiloader, bootmii y copia de la nand para asi tener un "seguro" para poder recuperar la consola en caso de fallos.