Prueba con otro formato, con el mismo wiibackup manager en la opcion de herramientas puedes formatear en wbfs o fat32 /32kb y prueba de nuevo. En caso de que no funcione probablemente la usb este dañada o no sea compatible. Aunque no paresca dañada puede estarlo prueba tranfieriendo varios archivos (directo de windows), si la velocidad de tranferencia es muy baja o aparece con espacio ocupado pero no estan los archivos (una vez tranferidos los archivos desconecta y vuelve a conectar) esta dañada y es muy dificil/imposible recuperarla.