mira haber si te lo has bajado de otra pagina que no haya sido scene beta porque la scene te coloca los archivos como los tienes que poner en la sd, asegurate que en la raiz de la sd este la carpeta apps y dentro de esta las dos aplicaciones en tu caso:

- ciosrev09

- usbsdloader

dentro de estas carpetas tienen que estar las aplicaciones con el nombre "boot.dol" (sin comillas) y el homebrew channel ya te tendria que leer las aplicaciones, por cierto para instalar el cios tienes que tener el archivo "IOS36-64-v1042.wad" en la raiz de la sd (viene con la descarga) si no lo vas a instalar por internet claro.