Esta es la opcion que mejor me ha funcionado hay varias maneras de hacerlo pero esta a mi parecer es la mejor. Te voy a pasar los archivos necesarios para que sea mas facil (espero no estar infringiendo las normas)

Primero descargate este archivo. Ya descomprimido mete lo que dice copiar en la raiz de tu sd o usb lo que quieras usar. Ahora abre el programa Showmiiwads y aceptas el acuerdo, en Opciones cambias el idioma, ahora en la opcion de Herramientas eliges la opcion Crear common key y en la ventana que aparece escribes lo que aparece entre comillas y das a ok. En Opciones eliges cambiar Ruta backup nand y buscas la carpeta que metiste en tu sd/usb llamada nands y eliges la carpeta pl_us y das a aceptar, en la opcion Ver eliges Showmiinand y te aparecera una lista con las cosas instaladas en la nand. No borres nada de lo que aparece ahi instalado.

Ahora para instalar los wiiware y virtual console vas a Archivo - Abrir carpeta y buscas la carpeta donde tengas los wad, esperas a que cargue la barra verde en la pate de abajo-derecha, una vez termina vas a la opcion Ver - Showmiiwads y te mostrara la lista con los wad. Seleccionas todos (no funciona ctrl + e) y das click derecho sobre alguno, en las opciones eliges Extraer - A nand y esperas a que termine la barra verde. Si quieres verificar que se instalaron Ver - showmiinand y en la lista te deben aparecer.

En la wii abres USB Loader Gx en la configuracion eliges la opcion Custom phats, buscas las opciones Nand Emu Phat y Nand Emu Channel y cambias la ubicacion a la carpeta pl_us (usb/sd: nands - pl_us) en ambas. Ahora vuelves a la pagina principal de la configuracion y eliges la opcion GUI Settings, buscas la opcion Show Favorite on banner y cambias la opcion a /\/\, vulves la pagina principal de configuracion y eliges Loader Settings buscas Emular partidas nand  lo cambias a Parcial y en Emular canales nand eliges Neek. *Opcional puedes ir a la opcion configuracion de las caracteristicas y aplicar las opciones de copiar miis a nand emu y copiar sysconf a nand emu.

Ya en el menu de USB Loader Gx en las opciones de arriba eliges la de los canales (puedes elegir la que quieras pero esta me gusta mas) luego en la opcion de seleccion de fuente (arriba junto a ABC) y seleccionas solo canales en Nand Emulada das en aceptar y listo ya deben aparecer los juegos que instalaste.

PD yo solo uso USB Loader gx para esto, para los juegos wii y gamecube uso cfg loader para asi no tener que estar cambiando las opciones y tener todo mejor organizado.